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      中國農業科學院(深圳)農業基因組研究所程時鋒課題組2022年誠聘博士后、助理研究員、科研助理

      來 源:科學人才網
      發布時間:2022-05-09

      基因組所介紹

      中國農業科學院深圳農業基因組研究所成立于2014年,由農業農村部、中國農業科學院和深圳市政府共同支持建設;蚪M所通過整合生物學和大數據科學,來認識與利用農業生物基因組,服務全球農業生產。為此,基因組所成立了組學技術、合成生物學、植物基因組、動物基因組、生態基因組、食品科學等研究中心和相關技術平臺;蚪M所的長期愿景是致力于通過顛覆性創新來促進全球農業可持續發展,服務于個性化食品供給體系,并提升人類健康水平和農民社會地位!

      成立以來,基因組所深入貫徹落實習近平總書記“四個面向、兩個一流”指示精神,開展科研自主權改革試點工作,被列為中國農科院現代院所改革的“試驗田”,建立了由中國農科院與深圳市主管領導任共同理事長的理事會;組建了1000多人的研究隊伍;形成了以組學技術為核心、輻射農業、食品和生態方向的學科體系,獲批“嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室深圳分中心”“農業農村部農業基因數據分析重點實驗室”等創新載體;在包括Science、Nature、Cell等頂級期刊在內的雜志上發表SCI論文400多篇,以基因組設計育種育成國審、省審新品種30余個,農業基因組學等研究領域占據世界前沿。2019年以來連續三年自然指數排名全國農業類科研院所第一名,多項成果入選“‘十三五’農業科技十大標志性成果”“中國生命科學十大進展”“中國農業科學十大進展”。先后獲得“何梁何利基金”獎、“周光召基礎科學獎”“深圳經濟特區建立40周年創新創業和先進模范人物”“深圳市市長獎”等獎勵。

      程時鋒課題組介紹

      程時鋒課題組目前以Trait-based phylogenomics (“C4光合”和“結瘤固氮”)為框架研究植物獲得適應性新性狀的分子機制、以Genomics-design Breeding(“小麥”和“豌豆”群本)為目標研究作物群體馴化和設計育種技術路線。代表性成果以第一或通訊作者(含共同)發表在Science(2篇)、CELL、Nature Biotechnology、Plant Cell等雜志,多篇文章被F1000重點推薦;主持國家重點研發計劃1項,省部級項目2項。

      課題組負責人程時鋒老師代表性論文

       *第一作者 †通訊作者

       1. Cheng S*, Wong G, Melkonian M. Giant DNA viruses make big strides in eukaryote evolution. Cell Host & Microbe (2021). https://doi.org/10.1016/j.chom.2021.01.008

       2. Cheng S*, Xian W, Fu Y, et al. Genomes of Subaerial Zygnematophyceae Provide Insights into Land Plant Evolution. Cell, 2019, 179(5): 1057-1067. e14.

       3. Griesmann M, Chang Y, Liu X, et al. Cheng S†. Phylogenomics reveals multiple losses of nitrogen-fixing root nodule symbiosis. Science, 2018, 361(6398): eaat1743.

       4. Cheng S*, Melkonian M, Smith SA, et al. 10KP: A phylodiverse genome sequencing plan. Gigascience. 2018;7(3):1–9.

       5. Cheng S*, Gutmann B, Zhong X, et al. Redefining the structural motifs that determine RNA binding and RNA editing by pentatricopeptide repeat proteins in land plants. Plant J. 2016;85(4):532–547.

       6. Lin S, Cheng S*, Song B, et al. The Symbiodinium kawagutii genome illuminates dinoflagellate gene expression and coral symbiosis. Science. 2015;350(6261):691–694.

       7. Cheng S*, van den Bergh E, Zeng P, et al. The Tarenaya hassleriana genome provides insight into reproductive trait and genome evolution of crucifers. Plant Cell. 2013;25(8):2813–2830.

       8. Zhang, G., Liu, X., Quan, Z. Cheng S*. et al. Genome sequence of foxtail millet (Setaria italica) provides insights into grass evolution and biofuel potential. Nat Biotechnol 30, 549–554 (2012).

       6. Lin S, Cheng S*, Song B, et al. The Symbiodinium kawagutii genome illuminates dinoflagellate gene expression and coral symbiosis. Science. 2015;350(6261):691–694.

       7. Cheng S*, van den Bergh E, Zeng P, et al. The Tarenaya hassleriana genome provides insight into reproductive trait and genome evolution of crucifers. Plant Cell. 2013;25(8):2813–2830.

       8. Zhang, G., Liu, X., Quan, Z. Cheng S*. et al. Genome sequence of foxtail millet (Setaria italica) provides insights into grass evolution and biofuel potential. Nat Biotechnol 30, 549–554 (2012).

      一、招聘崗位

      根據課題組工作需要,擬招聘:

      1. 博士后3名。

      2. 助理研究員4名。

      3. 科研助理1名。

      二、崗位職責

      (一)博士后/助理研究員

      具體職位可面談

      基因組深度學習方向(1人)

      1. 基因組功能元件、序列模型預測深度學習算法、流程開發。

      2. 植物大規模系統比較進化基因組學大數據分析和方法構建。

      3. 作物群體基因組學與數量遺傳學基因發現,開發基因與基因、基因與環境互作研究方法(QTN,QEI,QQI)

      4. 開發群體基因組大的結構性變異(pan-sv)、泛基因(pan-genome),以及基于大的結構變異與表型關聯分析方法(meta-QTL/GWAS)。

      5. 負責具體麥類與豆類群體項目。

      高通量表型與AI算法開發方向(1人)

      1. 開發高通量表征與量化麥類與豆類表型數據技術方法(分子表型、生理表型及農藝表型等)。

      2. 開發作物地下表型表征與量化方法。

      3. 利用AI等算法整合基因大數據,表型大數據,開發從Genetic variation到Phenotypic changes到Breeding Value表征量化預測方法。

      4. 負責具體麥類與豆類群體項目。

      比較基因組學及系統發育分子進化方向(2人)

      1. C4/CAM光合作用方法(1人)

      2. 結瘤共生固氮(1人)

      作物遺傳育種方向(1-2人)

      1. 作物田間實驗設計、規劃和管理。

      2. 負責育種基地管理和育種項目實施,包括作物的田間雜交、材料管護、品種選育等育種相關工作。

      3. 構建小麥或豌豆作圖群體,并開展群體鑒定、多點多年農藝性狀表型系統采集與分析。

      4. 開展目標性狀設計育種。

      (二)科研助理

      1. 協助課題組科研方向調研、協助基金與經費申請。

      2. 協助課題組項目管理與發展。

      3. 開展國際合作,從全球引進種質資源。

      4. 協助團隊綜合行政工作、跨部門協調溝通等。

      5. 課題組長安排的其他工作。

      三、應聘條件

      (一)博士后

      1. 獲得博士學位,數學、計算機科學、數理統計、生物信息學、物理學、基因組學、遺傳學、農學、植物學等相關專業。

      2. 原則上近三年以第一作者發表1篇中國科學院JCR二區(含共同第一作者,排名第一位),或影響因子20.0以上的SCI收錄學術研究論文(含共同第一作者,排名前兩位)。

      3. 基因組深度學習、基因編輯、高通量表型與AI算法開發方向要求熟練使用Linux系統,至少熟練掌握Perl、Python、R、C/C++、JAVA等語言中的兩種,或接受過系統分析生物學、生物化學、遺傳學訓練有豐富的分子和細胞生物學實驗基礎,能獨立開展植物基因編輯體系構建和相關研究工作。

      4. 作物表型和遺傳育種方向要求接受過系統的分子生物學、種質資源學、遺傳學培訓,具有海外學習研究經歷和遺傳育種研究背景者優先考慮。

      5. 熱愛科研,勤于思考,能獨立開展課題研究,學術態度嚴謹,善于團隊合作。

      6. 良好的溝通能力和中英文科研寫作能力。

      (二)助理研究員

      1. 具有碩士研究生及以上學歷,數學、計算機科學、數理統計、生物信息學、物理學、基因組學、遺傳學、農學、植物學等相關專業。

      2. 基因組深度學習、基因編輯、高通量表型與AI算法開發要求熟練使用Linux系統,至少熟練掌握Perl、Python、R、C/C++、JAVA等語言中的兩種,或接受過系統分析生物學、生物化學、遺傳學訓練有豐富的分子和細胞生物學實驗基礎,能獨立開展植物基因編輯體系構建和相關研究工作。

      3. 作物表型和遺傳育種方向要求接受過系統的分子生物學、種質資源學、遺傳學培訓,具有海外學習研究經歷和遺傳育種研究背景者優先考慮。

      4. 熱愛科研,勤于思考,能獨立開展課題研究,學術態度嚴謹,善于團隊合作。

      5. 良好的溝通能力和中英文科研寫作能力。

      (三)科研助理

      1. 具有本科及以上學歷,有生命科學類專業、英語能力較強者優先考慮。

      2. 工作認真,責任心強,時間觀念強,有良好的溝通能力、團隊協作精神。

      四、薪資待遇

      (一)博士后

      1. 按照深圳市、大鵬新區相關規定,博士后在站期間享受在站博士后生活補貼,具體金額以政府最新規定為準。

      2. 按照研究所的相關規定提供博士后的工資、五險一金和績效待遇。

      3. 符合條件的,可申請"博士后創新人才支持計劃"、"博士后國際交流計劃派出項目、引進項目"、廣東省海外博士后人才支持項目、中國農業科學院博士后"優農計劃",在站期間可申報"中國農業科學院優秀博士后"評審,入選者給予獎金獎勵。

      4. 博士后人員進站后,可選擇落戶深圳市,其配偶及未成年子女可辦理隨遷入戶。

      5. 符合條件的博士后可申請評定專業技術資格。

      6. 深圳市對出站博士后留深工作、簽訂3年勞動合同的,給予30萬元資助,用于科研投入或創業前期費用。

      7. 提供良好的工作環境和充足的研究經費,配備研究需要的設備和儀器,科研方向給予較高自由度。

      (二)助理研究員

      1. 提供具有市場競爭力的薪資待遇,相關社會保險及公積金按照深圳市有關規定執行。

      2.      符合條件的可選擇落戶深圳市,并且享受深圳市人才生活和租房補貼,具體金額以政府最新規定為準。

      3.      提供良好的工作環境和充足的研究經費,配備精良的實驗儀器,科研方向給予較高自由度。

      4.      提供良好的科研環境和深造學習培訓的機會,表現優異可協助推薦到國內外知名科研單位深造學習或開展科研合作。

      (三) 科研助理

      1. 提供具有市場競爭力的薪資待遇,相關社會保險及公積金按照深圳市有關規定執行。

      2.      符合條件的可選擇落戶深圳市,并且享受深圳市人才生活和租房補貼,具體金額以政府最新規定為準。

      3.      提供良好的科研環境和深造學習培訓的機會,表現優異可協助推薦到國內外知名科研單位深造學習或開展科研合作。

      五、申請方式

      申請者請將個人簡歷(包含教育經歷、研究經歷、論文發表)、代表作和工作規劃以電子郵件形式發送至:chengshifeng@caas.cn,抄送郵箱至znkyjyz@163.com。郵件主題和材料壓縮文件請注明"姓名+申請職位名稱 "。

      所有應聘材料我們將會嚴格保密,課題組會在收到申請的一個月內與初審合格者電話或E-mail聯系,安排面試。資格審查未通過者,不再另行告知。

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